Wymiennik jest „sercem” każdego rekuperatora. Jego głównym zadaniem jest odzysk ciepła, z powietrza usuwanego oddają energię cieplną do świeżego powietrza dostarczanego do domu.
Na rynku dostępne są rekuperatory z wymiennikami przeciwprądowymi oraz obrotowymi.
Trudno pokazać wyższość jednej z konstrukcji. Każda z nich ma swoje plusy i minusy. Do zalet wymiennika przeciwprądowego należy zaliczyć wyższy poziom odzysku temperatury. Przy zastosowaniu tego typu urządzenia powietrze usuwane mija się z powietrzem nawiewanym w równoległych kanalikach.
Działanie wymiennika obrotowego jest nieco inne. Powietrze wywiewane przyjmowane jest przez wymiennik gdzie oddaje swoją temperaturę, po czym następuje jego obrót do sekcji usuwającej powietrze na zewnątrz. Do tej czynności wykorzystywana jest energia elektryczna potrzebna do wprowadzenia rotora w ruch. Jest to jedna z głównych różnic między wymiennikami ( wymiennik obrotowy nie potrzebuje do funkcjonowania dodatkowej energii). Przy zastosowaniu centrali z rotorem nie potrzebujemy grzałki wstępnej, natomiast stosowana jest nagrzewnica wtórna w celu zwiększenia temperatury powietrza nawiewanego, co przekłada się na komfort użytkowania. Główną zaletą wymiennika obrotowego jest odzysk wilgoci z usuwanego powietrza.
Odpowiedzią producentów rekuperatorów przeciwprądowych na problem wilgoci jest zastosowanie wymiennika przeciwprądowego entalpicznego, który również ma za zadanie odzysk wilgoci.
Warto też zauważyć, że sprawność urządzenia z odzyskiem wilgoci jest niższa niż rekuperatorów przeciwprądowych.